Επίκουρος Καθηγητής Ιατρικής Μικροβιολογίας

Τμήμα Ιατρικής, Σχολής Επιστημών Υγείας

Πανεπιστήμιο Θεσσαλίας

Οι ερευνητικές μου δραστηριότητες εστιάζονται στην επιδημιολογική επιτήρηση της αντιμικροβιακής αντοχής (ιδίως της αντοχής στις εκτεταμένου φάσματος κεφαλοσπορίνες και τις καρβαπενέμες) στα Gram-αρνητικά βακτήρια (Enterobactacteriaceae and Pseudomonas spp.). Τα έργα, στα οποία έχω εργαστεί ή συμμετάσχει, είχαν ως στόχο την εκτέλεση μοριακής επιδημιολογίας των παραγόντων (όπως πλασμίδια, τρανσποζόνια, αλληλουχίες εισδοχής και ιντεγκρόνια) που επηρεάζουν τη διάδοση της πολλαπλής αντοχής στα παθογόνα μικρόβια, καθώς και το χαρακτηρισμό νέων μηχανισμών που προσφέρουν αντοχή στα αντιβιοτικά (β-λακτάμες, αμινογλυκοσίδες και πολυμυξίνες).

Επιπλέον, έχω εργαστεί στο χαρακτηρισμό και στην ανάλυση (με τη χρήση next generation sequencing) ολόκληρης της νουκλεοτιδικής αλληλουχίας αρκετών πλασμιδίων, τα οποία φέρουν σημαντικά γονίδια αντοχής. Τα συγκεκριμένα πλασμίδια έχουν θεωρηθεί υπεύθυνα για τη διασπορά σημαντικών μηχανισμών αντοχής τόσο σε νοσοκομεία (ή στην κοινότητα) στον ελλαδικό χώρο όσο και σε παγκόσμιο επίπεδο. Επίσης, ασχολούμαι με τη χρήση των νέων τεχνολογιών, όπως η MALDI-TOF MS και η Raman φασματοσκοπία, και η ανάπτυξη νέων δοκιμασιών για την ανίχνευση των μηχανισμών αντοχής σε κλινικά στελέχη. Το 2013, περιέγραψα την ανάπτυξη μίας νέας δοκιμασίας για τον προσδιορισμό των β-λακταμασών σε κλινικά στελέχη εντεροβακτηριοειδών με τη χρήση της MALDI-TOF MS τεχνικής.

Τα αποτελέσματα της ερευνητικής μου δραστηριότητας έχουν δημοσιευθεί σε 80 εργασίες σε διεθνή περιοδικά. Μέρος των αποτελεσμάτων έχει παρουσιαστεί σε προφορικές ή γραπτές ανακοινώσεις τόσο σε διεθνή όσο και ελληνικά συνέδρια. Τέλος, έχω συμβάλει στη συγγραφή τριών αγγλόφωνων επιστημονικών βιβλίων.

ΒΙΟΓΡΑΦΙΚΟ ΣΗΜΕΙΩΜΑ

1. ΠΑΡΟΥΣΑ ΘΕΣΗ

2. ΣΠΟΥΔΕΣ – ΤΙΤΛΟΙ

Ξένες γλώσσες
Άριστη προφορική και γραπτή επικοινωνία στην Αγγλική διάλεκτο. First Certificate in English, University of Cambridge (Lower degree).

Γνώση ηλεκτρονικών υπολογιστών
Άριστη γνώση του Microsoft Office (Word, Excel, PowerPoint). Επίσης, χρήση βιολογικών λογισμικών για την επεξεργασία και ανάλυση των δεδομένων αλληλούχισης.

3. ΜΕΤΕΚΠΑIΔΕΥΣΗ ΕΞΩΤΕΡΙΚΟΥ

4. ΔΙΑΚΡΙΣΕΙΣ

Α. Βραβεία

Εύφημη μνεία από τον Υπουργό Υγείας (της Δημοκρατίας της Τσεχίας) για την έρευνα στην ιατρική και στην ανάπτυξη για το έτος 2016, στους Jaroslav Hrabak, Constantinos Papagiannitsis, Helena Zemlickova, Tamara Bergerova, για το έργο ‘Ανάλυση κινητών γενετικών στοιχείων που φέρουν γονίδια για την κωδικοποίηση των μεταλλό-β-λακταμάσων στη Τσεχία

Β. Βραβευμένες Επιστημονικές Εργασίες

5. Παπαγιαννίτσης ΚΧ, Τζουβελέκης ΛΣ, Τζελέπη Ε, Μυριαγκού Β. Αξιολόγηση της ισχύος νέου τύπου υποκινητή στα ιντεγκρόνια τάξης 1. 34ο Ετήσιο Πανελλήνιο Ιατρικό Συνέδριο. Αθήνα, 2008.
Πρώτο Βραβείο Βασικής Έρευνας

4. Παπαγιαννίτσης ΚΧ, Λώλη Α, Τζελέπη Ε, Ζιώγα Α, Τζουβελέκης ΛΣ, Μυριαγκού Β. Χαρακτηρισμός δύο νέων πλασμιδιακών β-λακταμασών, ECL-1 και ACC-4, από κλινικό στέλεχος Escherichia coli. 33ο Ετήσιο Πανελλήνιο Ιατρικό Συνέδριο. Αθήνα, 2007.
Πρώτο Βραβείο Βασικής Έρευνας

3. Στάθη Μ, Αυγερινού Ε, Μυριαγκού Β, Φλεμετάκης Α, Δανιηλίδου Μ, Παπαγιαννίτσης ΚΧ, Ζίωγα Α, Κυριακής ΚΠ, Τζελέπη Ε. Επιτήρηση της ευαισθησίας του γονοκόκκου στα αντιβιοτικά στην Ελλάδα κατά τα έτη 1994-2005. Δραματική αυξηση αντοχής στις νεότερες κινολόνες. 32ο Ετήσιο Πανελλήνιο Ιατρικό Συνέδριο. Αθήνα, 2006.
Δεύτερο Βραβείο Αμφιαραείου Ιδρύματος

2. Παναγιωτακοπούλου Α, Δαϊκος ΓΛ, Λώλη Α, Παπαγιαννίτσης ΚΧ, Ζίωγα Α, Τζουβελέκης ΛΣ, ΤζελέπηΕ, Μυριαγκού Β. Αξιολόγηση ιμιπενέμης έναντι στελεχών Klebsiella pneumoniae που παράγουν
μέταλλο-β-λακταμάσες σε πειραματική λοίμωξη σε επίμυες. 32ο Ετήσιο Πανελλήνιο Ιατρικό Συνέδριο. Αθήνα, 2006.
Δεύτερο Βραβείο Αμφιαραείου Ιδρύματος

1. Ζίωγα Α, Παπαγιαννίτσης ΚΧ, Λώλη Α, Στάθη Μ, Τζελέπη Ε, Τάσιος ΠΘ, Τζουβελέκης ΛΣ, Μυριαγκού Β. Χαρακτηρισμός Πλασμιδίων Αντοχής στις Κεφαλοσπορίνες. Συμβολή στη φυλογένεση των β- λακταμασών τύπου CMY. 32ο Ετήσιο Πανελλήνιο Ιατρικό Συνέδριο. Αθήνα, 2006.
Πρώτο Βραβείο Βασικής Έρευνας

Γ. ΔΙΠΛΩΜΑ ΕΥΡΕΣΙΤΕΧΝΙΑΣ
Aποδεκτή αίτηση εθνικού διπλώματος ευρεσιτεχνίας (Τσεχία - PV 2013-473). "Μία μέθοδος για την ανίχνευση των β-λακταμασών σε Gram-αρνητικά βακτήρια με τη χρήση φασματομετρίας μάζας".

5. ΕΠΑΓΓΕΛΜΑΤΙΚΗ ΣΤΑΔΙΟΔΡΟΜΙΑ

6. ΕΚΠΑΙΔΕΥΤΙΚΟ ΕΡΓΟ

Α. ΔΙΔΑΣΚΑΛΙΑ ΣΕ ΠΡΟΠΤΥΧΙΑΚΟ Ή ΜΕΤΑΠΤΥΧΙΑΚΟ ΕΠΙΠΕΔΟ

Β. ΕΠΙΒΛΕΨΗ ΜΕΤΑΠΤΥΧΙΑΚΩΝ ΕΡΓΑΣΙΩΝ

Κατά τη διάρκεια της θητείας μου ως Επίκουρος Καθηγητής Ιατρικής Μικροβιολογίας στο Πανεπιστήμιο Θεσσαλίας

2018-2019 (Επιβλέπων): Μεταπτυχιακή εργασία της φοιτήτριας Γαλάνης Βασιλικής: Διερεύνηση της διασποράς των καρβαπενέμη-ανθεκτικών στελεχών Acinetobacter baumannii,στο Πανεπιστημιακό Νοσοκομείο της Λάρισας, το έτος 2018
2018-2019 (Επιβλέπων): Μεταπτυχιακή εργασία της φοιτήτριας Βέρρας Αγγελικής: Επιδημιολογική επιτήρηση στελεχών Pseudomonas aeruginosa, που απομονώθηκαν στο Πανεπιστημιακό Νοσοκομείο της Λάρισας, το έτος 2018

Γ. ΕΠΙΒΛΕΨΗ ΔΙΔΑΚΤΟΡΙΚΩΝ ΔΙΑΤΡΙΒΩΝ

Κατά τη διάρκεια της θητείας μου ως Επίκουρος Καθηγητής Μικροβιολογίας στο Πανεπιστήμιο του Καρόλου, Πίλσεν, Δημοκρατία της Τσεχίας
2014-2018 (Supervisor): (Anna Šrámková) Molecular epidemiological analysis of carbapenem resistant isolates of Enterobacteriaceae and Pseudomonas spp.
2014-2018 (Supervisor): (Kateřina Chudějová) Development and validation of methods for typing of bacteria by MALDI TOF mass spectrometry

2016-2019 (Supervisor): (Veronika Pašková) Development and validation of spectrometric methods (MALDI-TOF MS, Raman spectroscopy) for the early detection of infectious disease agents and their antibiotic resistance

7. ΚΛΙΝΙΚΟ ΕΡΓΟ

• Υπεύθυνος του Μοριακού τμήματος του Εργαστηρίου Μικροβιολογίας, με έμφαση στον προσδιορισμό του ιικού φορτίου της ηπατήτιδας B και C, καθώς και στην ταυτοποίηση των υπεύθυνων γονοτύπων (ηπατήτιδας C), για τη παρακολούθηση της θεραπείας των ασθενών.
• Επίσης, το τμήμα Μοριακής Μικροβιολογίας εμπλέκεται στη γρήγορη ανίχνευση του μυκοβακτηριδίου της φυματίωσης (Mycobacterium tuberculosis) και στον προσδιορισμό της αντοχής των στελεχών στα πρωτεύοντα αντιφυματικά αντιβιοτικά (ριφαμπικίνη και ισονιαζίδη). (2018 εώς σήμερα)
• Ενεργή συμμετοχή στη ρουτίνα του Ιολογικού εργαστηρίου, του οποίου ο ρόλος είναι η ορολογική διάγνωση νοσημάτων (π.χ. λεϊσμανίαση, βρουκέλωση, κα). (2019-2020)
  
• Ενεργή συμμετοχή στη ρουτίνα (διεξαγωγή εξωτερικού ποιοτικού ελέγχου, έλεγχος και έγκριση βιοχημικών και ορμονικών αναλύσεων) του εργαστηρίου Κλινικής Χημείας. (2020 εώς σήμερα)
  
• Ενεργή συμμετοχή στις εφημερίες του εργαστηρίου Κλινικής Χημείας. (2019 εώς σήμερα)

8. ΟΡΓΑΝΩΤΙΚΟ ΕΡΓΟ

ΣΥΜΜΕΤΟΧΗ ΣΤΗ ΔΙΟΡΓΑΝΩΣΗ ΣΥΝΕΔΡΙΩΝ

9. ΧΡΗΜΑΤΟΔΟΤΗΣΕΙΣ

Α. Ανταγωνιστικά ερευνητικά προγράμματα (Principal Investigator)

•  Clinical aspects of multidrug-resistant infections caused by gram-negative bacteria using a clinically relevant large mammal model of sepsis.
  Υπουργείο Υγείας της Δημοκρατίας της Τσεχίας (Czech Health Research Council), 7 621 000,-Kč (2017-2020).

Β. Ανταγωνιστικά ερευνητικά προγράμματα (Senior Researcher)

• Czech Health Research Council, Project: Enterobacteriaceae resistant to carbapenems and colistin: One-Health approach in addressing human and non-human sources of emerging resistance mechanisms. (2017-2020).
  
•  Agency for Health Research of the Czech Republic, Project: Molecular-Epidemiological Typing of Multiresistant Enterobacteriaceae and Pseudomonas spp. with Special Focus on their Silent Sources. (2015-2020; 10,914,000-Kč)

10. ΑΝΑΛΥΣΗ ΕΡΕΥΝΗΤΙΚΟΥ ΕΡΓΟΥ

Από το 2005, όπου ξεκίνησα να εργάζομαι στο εργαστήριο Βακτηριολογίας του Ελληνικού Ινστιτούτου Παστέρ για την εκπόνηση της διδακτορικής μου διατριβής, το αντικείμενο της ερευνητικής μου δραστηριότητας είναι η μελέτη της αντοχής των παθογόνων μικροβίων στα αντιβιοτικά. Το φαινόμενο της πολλαπλής αντοχής των παθογόνων βακτηρίων είναι ένα από τα σημαντικά θεραπευτικά προβλήματα στη σύγχρονη κλινική πράξη. Αυξημένα ποσοστά ανθεκτικών στα αντιβιοτικά βακτηρίων, που προκαλούν λοιμώξεις σε ανθρώπους, έχουν αναφερθεί από πολλές Ευρωπαϊκές χώρες. Η εμφάνιση των ανθεκτικών βακτηρίων έχει περιπλέξει την αντιβιοτική θεραπεία των λοιμώξεων και αύξησε σημαντικά το κόστος της. Συνεπώς, πολλές αναφορές που περιγράφουν την αποτυχία των θεραπευτικών σχημάτων που χρησιμοποιούνται στην ιατρική έχουν δημοσιευθεί τα τελευταία χρόνια.
Επιπλέον, η θνησιμότητα έχει αυξηθεί δραματικά λόγω αυτών των μη-θεραπεύσιμων λοιμώξεων. Το φαινόμενο της πολλαπλής αντοχής οφείλεται στην οργάνωση συγκροτημάτων γονιδίων αντοχής σε ποικιλία αντιβιοτικών (νησίδες πολλαπλής αντοχής). Η συγκρότηση των νησίδων πολλαπλής αντοχής
γίνεται με την απόκτηση νέων γονιδίων αντοχής με τη βοήθεια κινητών γενετικών μονάδων, όπως οι αλληλουχίες εισδοχής, τα μεταθετά στοιχεία και τα ιντεγκρόνια. Τα συγκροτήματα αυτά φέρονται συνήθως από μεταφερόμενα πλασμίδια, γεγονός που αυξάνει δραστικά τη δυνατότητα διασποράς τους.
Συγκεκριμένα, οι ερευνητικές μου δραστηριότητες εστιάζονται στην επιδημιολογική επιτήρηση της αντιμικροβιακής αντοχής (ιδίως της αντοχής στις εκτεταμένου φάσματος κεφαλοσπορίνες και τις καρβαπενέμες) στα Gram-αρνητικά βακτήρια (Enterobactacteriaceae and Pseudomonas spp.). Τα έργα, στα οποία έχω εργαστεί ή συμμετάσχει, είχαν ως στόχο την εκτέλεση μοριακής επιδημιολογίας των παραγόντων (όπως πλασμίδια, τρανσποζόνια, αλληλουχίες εισδοχής και ιντεγκρόνια) που επηρεάζουν τη διάδοση της πολλαπλής αντοχής στα παθογόνα μικρόβια, καθώς και το χαρακτηρισμό νέων μηχανισμών που προσφέρουν αντοχή στα αντιβιοτικά (β-λακτάμες, αμινογλυκοσίδες και πολυμυξίνες).
Επιπλέον, έχω εργαστεί στο χαρακτηρισμό και στην ανάλυση (με τη χρήση next generation sequencing) ολόκληρης της νουκλεοτιδικής αλληλουχίας αρκετών πλασμιδίων, τα οποία φέρουν σημαντικά γονίδια αντοχής. Τα συγκεκριμένα πλασμίδια έχουν θεωρηθεί υπεύθυνα για τη διασπορά σημαντικών μηχανισμών αντοχής τόσο σε νοσοκομεία (ή στην κοινότητα) στον ελλαδικό χώρο όσο και σε παγκόσμιο επίπεδο. Επίσης, ασχολούμαι με τη χρήση των νέων τεχνολογιών, όπως η MALDI-TOF MS και η Raman φασματοσκοπία, και η ανάπτυξη νέων δοκιμασιών για την ανίχνευση των μηχανισμών αντοχής σε κλινικά στελέχη. Το 2013, περιέγραψα την ανάπτυξη μίας νέας δοκιμασίας για τον προσδιορισμό των β-λακταμασών σε κλινικά στελέχη εντεροβακτηριοειδών με τη χρήση της MALDITOF MS τεχνικής. Τα αποτελέσματα της ερευνητικής μου δραστηριότητας έχουν δημοσιευθεί σε 80 εργασίες σε διεθνή περιοδικά. Μέρος των αποτελεσμάτων έχει παρουσιαστεί σε προφορικές ή γραπτές ανακοινώσεις τόσο σε διεθνή όσο και ελληνικά συνέδρια. Τέλος, έχω συμβάλει στη συγγραφή τριών αγγλόφωνων επιστημονικών βιβλίων.

11. ΑΛΛΕΣ ΕΠΙΣΤΗΜΟΝΙΚΕΣ ΔΡΑΣΤΗΡΙΟΤΗΤΕΣ

Α. Κριτής (Reviewer) σε Grant Agency
- Κριτής για το Czech Health Research Council (established by Ministry of Health of the Czech Republic;
2018, 2019, 2020).
Β. Συντάκτης (Editor) σε Ξενόγλωσσα Επιστημονικά Περιοδικά
Member of Editorial Board
-BMC microbiology (2020 εώς σήμερα)
-BMC infectious diseases (2020 εώς σήμερα)
-Frontiers Cellular and Infection Microbiology (2021 εώς σήμερα)
Guest editor
- Guest editor of Frontiers in Microbiology in the Research Topic (2019-2020): ‘Characterization of
Mobile Genetic Elements associated with Acquired Resistance Mechanisms’.
- Guest editor of the journal Microorganisms in the Research Topic (2020-2021): ‘Systems Involved in
Antimicrobial Resistance and Virulence of Clinically Important Pathogens’.
Γ. ΚΡΙΤΗΣ (REVIEWER) ΣΕ ΞΕΝΟΓΛΩΣΣΑ ΕΠΙΣΤΗΜΟΝΙΚΑ ΠΕΡΙΟΔΙΚΑ Antimicrobial Agents and Chemotherapy (2017-2019),
BMC infectious diseases (2018-2020),
Clinical Microbiology and Infection (2017-2020),
Diagnostic Microbiology and Infectious Diseases (2017, 2018, 2020),
European Journal of Clinical Microbiology & Infectious Diseases (2019, 2020),
Emerging Microbed & Infections (2019, 2020),
Eurosurveillance (2018),
Frontiers in Microbiology (2018-2020),
Future Microbiology (2017-2020),
International Journal of Antimicrobial Agents (2016, 2019),
Journal of Antimicrobial Chemotherapy (2016-2020),
Journal of Clinical Microbiology (2016),
Journal of Global Antimicrobial Resistance (2016-2020),
Journal of Medical Microbiology (2018-2020),
Journal of Microbiological Methods (2017, 2018, 2020)
Microbial Drug Resistance (2016-2018, 2020),
Infection, Genetics and Evolution (2018-2019),
Microorganisms (2019-2020),
mSphere (2018-2020).

12. ΣΥΓΓΡΑΦΙΚΟ ΕΡΓΟ

Α. ΚΕΦΑΛΑΙΑ ΣΕ ΒΙΒΛΙΑ
i. Ξενόγλωσσα
1. Petinaki E, Papagiannitsis C. (2018) Resistance of Staphylococci to Macrolides-LincosamidesStreptogramins B (MLSB): Epidemiology and Mechanisms of Resistance. 1-17, Staphylococcus Aureus, IntechOpen.
2. Hrabak J, Dolejska M, Papagiannitsis CC. (2016) Matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry for determination of resistance to antibiotics. In book: MALDITOF Mass Spectrometry in Microbiology, Edition: 1, Chapter: 5, Publisher: Caister Academic Press, Editors: Markus Kostrzewa, Sören Schubert, pp.93-108.
3. Hrabak J, Havlicek V, Papagiannitsis CC. (2016) Detection of β-lactamases and their activity using MALDI-TOF MS. In book: Applications of Mass Spectrometry in Microbiology, Edition: 1, Chapter: Chapter 12, Publisher: Springer International Publishing, Editors: Plamen Demirev, Todd R Sandrin, pp.305-316.

Β. ΔΗΜΟΣΙΕΥΣΕΙΣ ΣΕ ΞΕΝΟΓΛΩΣΣΑ ΠΕΡΙΟΔΙΚΑ ΜΕ ΚΡΙΤΕΣ [Με αστερίσκο (*) σημειώνονται οι εργασίες που προέρχονται από το Παν. Θεσσαλίας μετά την εκλογή μου στη θέση του Επίκουρου Καθηγητή]
Σύνολο δημοσιεύσεων: 80
- Εργασίες από το Παν. Θεσσαλίας (Ημερομηνία ΦΕΚ διορισμού): 17
- Εργασίες από την Ημερομηνία ΦΕΚ διορισμού: 28
- Εργασίες που είμαι πρώτος: 32
- Εργασίες που είμαι τελευταίος: 5
- Εργασίες που είμαι ‘corresponding author’: 21
Σύνολο impact factor: 274.213
- Σύνολο impact factor για εργασίες από Παν. Θεσσαλίας: 52.086
- Σύνολο impact factor από εργασίες από την Ημερομηνία ΦΕΚ διορισμού: 86.147
Σύνολο βιβλιογραφικών αναφορών: 1437
Μέσος όρος impact factor ανά δημοσίευση: 3.42
h index: 21

1. (*) Chudejova K, Kraftova L, Mattioni Marchetti V, Hrabak J, Papagiannitsis CC, Bitar I. (2021) Genetic plurality of OXA/NDM-encoding features characterized from Enterobacterales recovered from Czech Hospitals. Front Microbiol. 12:641415. (IF: 4.235)
2. (*) Zelendova M, Papagiannitsis CC, Valcek A, Medvecky M, Bitar I, Hrabak J, Gelbicova T, Barakova A, Kutilova I, Karpiskova R, Dolejska M. (2021) Characterization of the complete nucleotide sequences of mcr-1-encoding plasmids from Enterobacterales isolates in retailed raw meat Products from the Czech Republic. Front Microbiol. 11:604067. (IF: 4.235)
3. (*) Malli E, Tsilipounidaki K, Xitsas S, Pyridou P, Papagiannitsis CC, Petinaki E. (2021) Implementation of the Rapid Polymyxin Acinetobacter Test to Detect Colistin-Resistant Acinetobacter baumannii. Microb. Drug Resist. 27: 134–135. (IF: 2.519)
4. Kutilova I, Valcek A, Papagiannitsis CC, Cejkova D, Masarikova M, Paskova V, Davidova-Gerzova L, Videnska P, Hrabak J, Literak I, Dolejska M. (2021) Carbapenemase-producing Gram-negative βacteria from American Crows in the USA. Antimicrob Agents Chemother. AAC.00586-20. (IF: 4.715)
5. (*) Papagiannitsis CC, Verra A, Galani V, Xitsas S, Bitar I, Hrabak J, Petinaki E. Unravelling the (2020) Features of Success of VIM-Producing ST111 and ST235 Pseudomonas aeruginosa in a Greek Hospital. Microorganisms. 8(12):E1884. (IF: 4.167)
6. Paskova V, Chudejova K, Sramkova A, Kraftova L, Jakubu V, Petinaki E, Zemlickova H, Neradova K, Papagiannitsis CC, Hrabak J. (2020) Insufficient repeatability and reproducibility of MALDI-TOF MSbased identification of MRSA. Folia Microbiol (Praha) 65(5):895-900. (IF: 1.730)
7. (*) Galani V, Papagiannitsis CC, Petinaki E. First description of ST409 OXA-23-producing Acinetobacter baumannii, carrying a CST8 CRISPR/Cas system, in Central Greece. J Glob Antimicrob Resist. 22:137-138. (IF: 2.706)
8. Bitar I, Medvecky M, Amlerova J, Papagiannitsis CC, Hrabak J. Frequency of mutations associated with resistance to first- and second-line drugs in multidrug-resistant Mycobacterium tuberculosis isolates. J Glob Antimicrob Resist. 22:275-282. (IF: 2.706)
9. Spanelova P, Jakubu V, Malisova L, Musilek M, Kozakova J, Papagiannitsis CC, Bitar I, Hrabak J, Pantosti A, Del Grosso M, Zemlickova H. (2020) Whole genome sequencing of macrolide resistant Streptococcus pneumoniae serotype 19A sequence type 416. BMC Microbiol. 25;20(1):224. (IF: 2.989)
10. Hrabak J, Bitar I, Papagiannitsis CC. (2020) Combination of mass spectrometry and DNA sequencing for detection of antibiotic resistance in diagnostic laboratories. Folia Microbiol (Praha). 65(2):233- 243. (IF: 1.730)
11. (*) Bitar I, Papagiannitsis CC, Kraftova L, Chudejova K, Mattioni Marchetti V, Hrabak J. (2020) Detection of five mcr-9-Carrying Enterobacterales isolates in four Czech hospitals. mSphere. 5(6):e01008-20. (IF: 4.28)
12. (*) Tsolaki V, Mantzarlis K, Mpakalis A, Malli E, Tsimpoukas F, Tsirogianni A, Papagiannitsis C, Zygoulis P, Papadonta ME, Petinaki E, Makris D, Zakynthinos E. (2020) Ceftazidime-Avibactam To Treat Life-Threatening Infections by Carbapenem-Resistant Pathogens in Critically Ill Mechanically Ventilated Patients. Antimicrob Agents Chemother. 64(3):e02320-19. (IF: 4.415)
13. (*) Malli E, Papagiannitsis CC, Stelios Xitsas S, Tsilipounidaki K, Efi Petinaki E. (2019) Implementation of the rapid Poymyxin™ NP test directly to positive blood cultures bottles. Diagn. Microbiol. Infect. Dis. 95(4):114889. (IF: 2.499)
14. (*) Papagiannitsis CC, Bitar I, Malli E, Tsilipounidaki K, Hrabak J, Petinaki E. (2019) IncC blaKPC-2- positive plasmid characterised from ST648 Escherichia coli. J. Glob. Antimicrob. Resist. 19,73-77. (IF: 2.706)
15. (*) Vasileiou NGC, Sarrou S, Papagiannitsis C, Chatzopoulos DC, Malli E, Mavrogianni VS, Petinaki E, Fthenakis GC. (2019) Antimicrobial agent susceptibility and typing of staphylococcal isolates from subclinical mastitis in ewes. Microb. Drug Resist. 25,1099-1110. (IF: 2.519)
16. (*) Papagiannitsis CC, Tsilipounidaki K, Malli E, Petinaki E. (2019) Detection in Greece of a clinical Enterococcus faecium isolate carrying the novel oxazolidinone resistance gene poxtA. J. Antimicrob. Chemother. 74, 2461-2462. (IF: 5.219)
17. (*) Tsilipounidaki K, Gerontopoulos A, Papagiannitsis C, Petinaki E. (2019) First detection of an optrA-positive, linezolid-resistant ST16 Enterococcus faecalis from human in Greece. New Microbes New Infect. 29, 100515.
18. (*) Sarrou S, Malli E, Tsilipounidaki K, Florou Z, Medvecky M, Skoulakis A, Hrabak J, Papagiannitsis CC, Petinaki E. (2019) MLSB-Resistant Staphylococcus aureus in Central Greece: Rate of Resistance and Molecular Characterization. Microb. Drug Resist. 25, 543-550. (IF: 2.519)
19. (*) Chatedaki C, Voulgaridi I, Kachrimanidou M, Hrabak J, Papagiannitsis CC, Petinaki E. (2019) Antimicrobial susceptibility and mechanisms of resistance of Greek Clostridium difficile clinical isolates. J. Glob. Antimicrob. Resist. 16, 53-58. (IF: 2.706)
20. (*) Malli E, Florou Z, Tsilipounidaki K, Voulgaridi I, Stefos A, Xitsas S, Papagiannitsis CC, Petinaki E. (2018) Evaluation of rapid polymyxin NP test to detect colistin-resistant Klebsiella pneumoniae isolated in a tertiary Greek hospital. J. Microbiol. Methods. 53, 35-39. (IF: 1.707)
21. Dolejska M, Papagiannitsis CC. (2018) Plasmid-mediated resistance is going wild. Plasmid. 99, 99- 111. (IF: 2.805)
22. Kutilova I, Janecko N, Cejkova D, Literak I, Papagiannitsis CC, Dolejska M. (2018) Characterization of blaKPC-3-positive plasmids from an Enterobacter aerogenes isolated from a corvid in Canada. J. Antimicrob. Chemother. 73, 2573-2575. (IF: 5.219)
23. (*) Papagiannitsis CC, Malli E, Tsilipounidaki K, Sarrou S, Medvecky M, Hrabak J, Fthenakis GC, Petinaki E. (2018) First description in Greece of mphC-positive staphylococci causing subclinical mastitis in ewes. Microb. Drug Resist. 24, 1050-1053. (IF: 2.519)
24. Paskova V, Medvecky M, Skalova A, Chudejova K, Bitar I, Jakubu V, Bergerova T, Zemlickova H, Papagiannitsis CC, Hrabak J. (2018) Characterization of NDM-Encoding Plasmids from Enterobacteriaceae Recovered From Czech Hospitals. Front. Microbiol. 9, 1549. (IF: 4.259)
25. Žemličková H, Mališová L, Španělová P, Jakubů V, Kozáková J, Musílek M, Medvecký M, Papagiannitsis CC. (2018) Corrigendum: Molecular characterization of serogroup 19 Streptococcus pneumoniae in the Czech Republic in the post-vaccine era. J Med Microbiol. 67, 1202. (IF: 2.156)
26. (*) Papagiannitsis CC, Sarrou S, Tsilipounidaki K, Malli E, Medvecky M, Hrabak J, Fthenakis GC, Petinaki E. (2018) Characterisation of a ST100 Staphylococcus epidermidis producing an LnuB
nucleotidyltransferase: Evidence for interspecies spread of an lnuB-carrying transposon. J. Glob. Antimicrob. Resist. 13, 9-10. (IF: 2.706)
27. Papagiannitsis CC, Paskova V, Chudejova K, Medvecky M, Bitar I, Jakubu V, Zemlickova H, Jirsa R, Hrabak J. (2018) Characterization of pEncl-30969cz, a novel ColE1-like plasmid encoding VIM-1
carbapenemase, from an Enterobacter cloacae sequence type 92 isolate. Diagn. Microbiol. Infect. Dis. 91(2):191-193. (IF: 2.499)
28. Dolejska M, Papagiannitsis CC, Medvecky M, Davidova-Gerzova L, Valcek A. (2018) Characterization of the complete nucleotide sequences of IMP-4-encoding plasmids, belonging to diverse Inc
families, recovered from Enterobacteriaceae of wildlife origin. Antimicrob. Agents Chemother. 62(5):e02434-17. (IF: 4.715)
29. Kukla R, Chudejova K, Papagiannitsis CC, Medvecky M, Habalova K, Hobzova L, Bolehovska R, Pliskova L, Hrabak J, Zemlickova H. (2018) Characterization of KPC-encoding plasmids from Enterobacteriaceae isolated in a Czech hospital. Antimicrob. Agents Chemother. 62, pii: e02152-17. (IF: 4.715)
30. Chudejova K, Rotova V, Skalova A, Medvecky M, Adamkova V, Papagiannitsis CC, Hrabak J. (2018) Emergence of sequence type 252 Enterobacter cloacae producing GES-5 carbapenemase in a Czech
hospital. Diagn. Microbiol. Infect. Dis. 90, 148-150. (IF: 2.499)
31. Rotova V, Papagiannitsis CC, Chudejova K, Medvecky M, Skalova A, Adamkova V, Hrabak J. (2017) First description of the emergence of Enterobacter asburiae producing IMI-2 carbapenemase in the
Czech Republic. J. Glob. Antimicrob. Resist. 11, 98-99. (IF: 2.706)
32. Papagiannitsis CC, Malli E, Florou Z, Medvecky M, Sarrou S, Hrabak J, Petinaki E. (2017) First description in Europe of the emergence of Enterococcus faecium ST117 carrying both vanA and
vanB genes, isolated in Greece. J. Glob. Antimicrob. Resist. 11, 68-70. (IF: 2.706)
33. Chudejova K, Bohac M, Skalova A, Rotova V, Papagiannitsis CC, Hanzlickova J, Bergerova T, Hrabák J. (2017) Validation of a novel automatic deposition of bacteria and yeasts on MALDI target for
MALDI-TOF MS-based identification using MALDI Colonyst robot. PLoS One. 12, e0190038. (IF: 2.740)
34. Papagiannitsis CC, Medvecky M, Chudejova K, Skalova A, Rotova V, Spanelova P, Jakubu V, Zemlickova H, Hrabak J; Czech Participants of the European Antimicrobial Resistance Surveillance
Network. (2017) Molecular characterization of carbapenemase-producing Pseudomonas aeruginosa of Czech origin and evidence for clonal spread of extensively resistant Sequence Type 357 expressing IMP-7 metallo-β-lactamase. Antimicrob. Agents Chemother. 61, e01811-17. (IF: 4.715)
35. Papagiannitsis CC, Kutilova I, Medvecky M, Hrabak J, Dolejska M. (2017) Characterization of the complete nucleotide sequences of IncA/C2 plasmids carrying In809-Like integrons from
Enterobacteriaceae isolates of wildlife origin. Antimicrob. Agents Chemother. 61, e01093-17. (IF: 4.715)
36. Rotova V, Papagiannitsis CC, Skalova A, Chudejova K, Hrabak J. (2017) Comparison of imipenem and meropenem antibiotics for the MALDI-TOF MS detection of carbapenemase activity. J.
Microbiol. Methods. 137, 30-33. (IF: 1.707)
37. Papousek I, Papagiannitsis CC, Hrabak J, Dolejska M. (2017) Complete nucleotide sequences of two VIM-1-encoding plasmids from Klebsiella pneumoniae and Leclercia adecarboxylata isolates of
Czech origin. Antimicrob. Agents Chemother. 61, e02648-16. (IF: 4.715)
38. Papagiannitsis CC, Tzouvelekis LS, Tzelepi E, Miriagou V. (2016) attI1-Located small ORFs (ORF-17 and ORF-11) in a class 1 integron affect expression of a gene cassette possessing a canonical ShineDalgarno sequence. Antimicrob. Agents Chemother. 61, e02070-16. (IF: 4.715)
39. Papagiannitsis CC, Malli E, Florou Z, Sarrou S, Hrabak J, Mantzarlis K, Zakynthinos E, Petinaki E. (2017) Emergence of sequence type 11 Klebsiella pneumoniae coproducing NDM-1 and VIM-1 metallo-β-lactamases in a Greek hospital. Diagn. Microbiol. Infect. Dis. 87, 295-297. (IF: 2.499)
40. Skalova A, Chudejova K, Rotova V, Medvecky M, Studentova V, Chudackova E, Lavicka P, Bergerova T, Jakubu V, Zemlickova H, Papagiannitsis CC, Hrabak J. (2017) Molecular characterization of OXA-
48-like-producing Enterobacteriaceae in the Czech Republic: evidence for horizontal transfer of pOXA-48-like plasmids. Antimicrob. Agents Chemother. 61, e01889-e01916. (IF: 4.715)
41. Papagiannitsis CC, Di Pilato V, Giani T, Giakkoupi P, Riccobono E, Landini G, Miriagou V, Vatopoulos AC, Rossolini GM. (2016) Characterization of KPC-encoding plasmids from two endemic settings,
Greece and Italy. J. Antimicrob. Chemother. 71, 2824-2830. (IF: 5.219)
42. Papagiannitsis CC, Dolejska M, Izdebski R, Giakkoupi P, Skálová A, Chudějová K, Dobiasova H, Vatopoulos AC, Derde LP, Bonten MJ, Gniadkowski M, Hrabák J. (2016) Characterisation of IncA/C2
plasmids carrying an In416-like integron with the blaVIM-19 gene from Klebsiella pneumoniae ST383 of Greek origin. Int. J. Antimicrob. Agents 47, 158-162. (IF: 4.621)
43. Oikonomou O, Sarrou S, Papagiannitsis CC, Georgiadou S, Mantzarlis K, Zakynthinos E, Dalekos GN, Petinaki E. (2015) Rapid dissemination of colistin and carbapenem resistant Acinetobacter
baumannii in Central Greece: mechanisms of resistance, molecular identification and epidemiological data. BMC Infect. Dis. 15, 55,9. (IF: 2.688)
44. Papagiannitsis CC, Izdebski R, Baraniak A, Fiett J, Herda M, Hrabak J, Derde LP, Bonten MJ, Carmeli Y, Goossens H, Hryniewicz W, Brun-Buisson C, Gniadkowski M; MOSAR WP2, WP3 and WP5 study
groups; MOSAR WP2 WP3 and WP5 study groups. (2015) Survey of metallo-β-lactamase-producing Enterobacteriaceae colonizing patients in European ICUs and rehabilitation units, 2008-11. J. Antimicrob. Chemother. 70, 1981-1988. (IF: 5.219)
45. Papagiannitsis CC, Pollini S, De Luca F, Rossolini GM, Docquier JD, Hrabák J. (2015) Biochemical characterization of VIM-39, a VIM-1-like metallo-β-lactamase variant from a multidrug-resistant
Klebsiella pneumoniae isolate from Greece. Antimicrob. Agents Chemother. 59, 7811-7814. (IF: 4.715)
46. Hrabák J, Študentová V, Adámková V, Šemberová L, Kabelíková P, Hedlová D, Čurdová M, Zemlickova H, Papagiannitsis CC. (2015) Report on transborder spread of carbapenemaseproducing bacteria by a patient injured during Euromaidan, Ukraine. New Microbes New Infect. 8, 28-30.
47. Papagiannitsis CC, Dolejska M, Izdebski R, Dobiasova H, Studentova V, Esteves FJ, Derde LP, Bonten MJ, Hrabak J, Gniadkowski M. (2015) Characterization of pKP-M1144, a novel ColeE1-like plasmid
encoding IMP-8, GES-5, and BEL-1 β-lactamases, from a Klebsiella pneumoniae Sequence Type 252 isolate. Antimicrob. Agents Chemother. 59, 5065-5068. (IF: 4.715)
48. Hrabak J, Studentova V, Jakubu V, Adamkova V, Dvorakova L, Balejova M, Bergerova T, Chmelarova E, Jezek P, Kabelikova P, Kolar M, Paterova P, Tejkalova R, Papagiannitsis CC, Zemlickova H. (2015)
Prevalence study on carbapenemase-producing Escherichia coli and Klebsiella pneumoniae isolates in Czech hospitals--results from Czech Part of European Survey on Carbapenemase-Producing
Enterobacteriaceae (EuSCAPE). Epidemiol. Mikrobiol. Imunol. 64, 87-91. (IF: 0.170)
49. Trojanek M, Dedicova D, Zemlickova H, Jakubu V, Malikova E, Reisingerova M, Gabrielova A, Papagiannitsis CC, Hrabak J, Horova B, Urbaskova P, Maresova V, Stejskal F. (2015) Enteric fever
imported to the Czech Republic: epidemiology, clinical characteristics and antimicrobial susceptibility. Folia Microbiol. 60, 217-224. (IF: 1.730)
50. Studentova V, Papagiannitsis CC, Izdebski R, Pfeifer Y, Chudackova E, Bergerova T, Gniadkowski M, Hrabak J. (2015) Detection of OXA-48-type carbapenemase-producing Enterobacteriaceae in
diagnostic laboratories can be enhanced by addition of bicarbonates to cultivation media or reaction buffers. Folia Microbiol. 60, 119-129. (IF: 1.730)
51. Studentova V, Dobiasova H, Hedlova D, Dolejska M, Papagiannitsis CC, Hrabak J. (2015) Complete Nucleotide Sequences of Two NDM-1-Encoding Plasmids from the Same Sequence Type 11
Klebsiella pneumoniae Strain. Antimicrob. Agents Chemother. 59, 1325-1328. (IF: 4.715)
52. Papagiannitsis CC, Studentova V, Izdebski R, Oikonomou O, Pfeifer Y, Petinaki E, Hrabak J. (2015) MALDI-TOF MS meropenem hydrolysis assay with NH4HCO3, a reliable tool for the direct detection
of carbapenemase activity. J. Clin. Microbiol. 53, 1731-1735. (IF: 5.897)
53. Papagiannitsis CC, Studentova V, Jakubu V, Spanelova P, Urbaskova P, Zemlickova H, Hrabak J. (2015) High Prevalence of ST131 Among CTX-M-Producing Escherichia coli from CommunityAcquired Infections, in the Czech Republic. Microb. Drug Resist. 21, 74-84. (IF: 2.519)
54. Hrabak J, Chudackova E, Papagiannitsis CC. (2014) Detection of carbapenemases in Enterobacteriaceae: a challenge for diagnostic microbiological laboratories. Clin. Microbiol. Infect. 20, 839-853. (IF: 6.425)
55. Papagiannitsis CC, Kotsakis SD, Tuma Z, Gniadkowski M, Miriagou V, Hrabak J. (2014) Identification of CMY-2-type cephalosporinases in clinical isolates of Enterobacteriaceae by MALDI-TOF MS.
Antimicrob. Agents Chemother. 58, 2952-2957. (IF: 4.715)
56. Papagiannitsis CC, Studentova V, Chudackova E, Bergerova T, Hrabak J, Radej J, Novak I. (2013) Identification of a New Delhi Metallo-β-lactamase-4 (NDM-4)-producing Enterobacter cloacae from a Czech patient previously hospitalized in Sri Lanka. Folia Microbiol. 58, 547-549. (IF: 1.730)
57. Papagiannitsis CC, Miriagou V, Giakkoupi P, Tzouvelekis LS, Vatopoulos AC. (2013) Characterization of pKP1780, a novel IncR plasmid from the emerging Klebsiella pneumoniae ST147, encoding the
VIM-1 metallo-β-lactamase. J. Antimicrob. Chemother. 68, 2259-2262. (IF: 5.219)
58. Papagiannitsis CC, Giakkoupi P, Kotsakis SD, Tzelepi E, Tzouvelekis LS, Vatopoulos AC. (2013) OmpK35 and OmpK36 porin variants associated with specific sequence types of Klebsiella
pneumoniae. J. Chemother. 25, 250-254. (IF: 1.661)
59. Papagiannitsis CC, Miriagou V, Giakkoupi P, Tzouvelekis LS, Vatopoulos AC. (2013) Characterization of pKP1433, a novel KPC-2-encoding plasmid from Klebsiella pneumoniae sequence type 340.
Antimicrob. Agents Chemother. 57, 3427-3429. (IF: 4.715)
60. Papagiannitsis CC, Studentova V, Ruzicka F, Tejkalova R, Hrabak J. (2013) Molecular characterization of metallo-β-lactamase producing Pseudomonas aeruginosa in a Czech hospital (2009-2011). J.
Med. Microbiol. 62, 945-946. (IF: 2.156)
61. Papagiannitsis CC, Studentova V, Hrabak J, Kubele J, Jindrak V, Zemlickova H. (2013) Isolation from a non-clinical sample of a Leclercia adecarboxylata producing a VIM-1 metallo-β-lactamase.
Antimicrob. Agents Chemother. 57, 2896-2897. (IF: 4.715)
62. Hrabak J, Papagiannitsis CC, Studentova V, Jakubu V, Fridrichova M, Zemlickova H; Czech Participants of European Antimicrobial Resistance Surveillance Network. (2013) Carbapenemaseproducing Klebsiella pneumoniae in the Czech Republic in 2011. Euro. Surveill. 18, 20626. (IF: 6.454)
63. Papagiannitsis CC, Miriagou V, Kotsakis SD, Tzelepi E, Vatopoulos AC, Petinaki E, and Tzouvelekis LS. (2012) Characterization of a transmissible plasmid encoding VEB-1 and VIM-1 in Proteus mirabilis.
Antimicrob. Agents Chemother. 56, 4024-4025. (IF: 4.715)
64. Willemse-Erix D, Bakker-Schut T, Slagboom-Bax F, Jachtenberg JW, Lemmens-den Toom N, Papagiannitsis CC, Kuntaman K, Puppels G, van Belkum A, Severin JA, Goessens W, Maquelin K.
(2012) Rapid typing of extended spectrum β-lactamase and carbapenemase producing Escherichia coli and Klebsiella pneumoniae isolates using SpectraCellRA®. J. Clin. Microbiol. 50, 1370-1375. (IF: 5.897)
65. Papagiannitsis CC, Tryfinopoulou K, Giakkoupi P, Pappa O, Polemis M, Tzelepi E, Tzouvelekis LS, The Carbapenemase Study Group and Vatopoulos AC. (2012) Diversity of acquired β-lactamases
amongst Klebsiella pneumoniae in Greek hospitals. Int. J. Antimicrob. Agents 39, 178-180. (IF: 4.621)
66. Papagiannitsis CC, Kotsakis SD, Petinaki E, Vatopoulos AC, Tzelepi E, Miriagou V, Tzouvelekis LS. (2011) Characterization of metallo-β-lactamase VIM-27, an A57S mutant of VIM-1 associated with
Klebsiella pneumoniae ST147. Antimicrob. Agents Cheother. 55, 3570-3572. (IF: 4.715)
67. Giakkoupi P, Papagiannitsis CC, Miriagou V, Pappa O, Polemis M, Tryfinopoulou K, Tzouvelekis LS, Vatopoulos AC. (2011) An update of the evolving epidemic of blaKPC-2-carrying Klebsiella
pneumoniae in Greece (2009-2010). J. Antimicrob. Chemother. 66, 1510-1513. (IF: 5.219)
68. Papagiannitsis CC, Tzouvelekis LS, Kotsakis SD, Tzelepi E, Miriagou V. (2010) Sequence of pR3521, an IncB plasmid from Escherichia coli encoding ACC-4, SCO-1, and TEM-1 β-lactamases. Antimicrob.
Agents Chemother. 55, 376-381. (IF: 4.715)
69. Papagiannitsis CC, Giakkoupi P, Vatopoulos AC, Tryfinopoulou K, Miriagou V, Tzouvelekis LS. (2010) Emergence of Klebsiella pneumoniae of a novel sequence type (ST383) producing VIM-4, KPC-2 and
CMY-4 β-lactamases. Int. J. Antimicrob. Agents 36, 573-574. (IF: 4.621)
70. Avlami A, Bekris S, Ganteris G, Kraniotaki E, Malamou-Lada E, Orfanidou M, Paniara O, Pantazatou A, Papagiannitsis CC, Platsouka E, Tzelepi E, Vagiakou H, Miriagou V. (2010) Detection of metallo-β-
lactamase genes in clinical specimens by a commercial multiplex PCR system. J. Microbiol. Methods 83, 185-187. (IF: 1.707)
71. Miriagou V, Papagiannitsis CC, Kotsakis SD, Loli A, Tzelepi E, Legakis NJ, Tzouvelekis LS. (2010) Sequence of pNL194, a 79.3-kilobase IncN plasmid carrying the blaVIM-1 metallo-beta-lactamase
gene in Klebsiella pneumoniae. Antimicrob. Agents Chemother. 54, 4497-4502. (IF: 4.715)
72. García-Fernández A, Miriagou V, Papagiannitsis CC, Giordano A, Venditti M, Mancini C, Carattoli A. (2010) An ertapenem-resistant extended-spectrum-beta-lactamase-producing Klebsiella
pneumoniae clone carries a novel OmpK36 porin variant. Antimicrob. Agents Chemother. 54, 4278- 4184. (IF: 4.715)
73. Kotsakis SD, Papagiannitsis CC, Tzelepi E, Legakis NJ, Miriagou V, Tzouvelekis LS. (2010) GES-13, a beta-lactamase variant possessing Lys-104 and Asn-170 in Pseudomonas aeruginosa. Antimicrob. Agents Chemother. 54, 1331-1333. (IF: 4.715)
74. Miriagou V, Papagiannitsis CC, Tzelepi E, Casals JB, Legakis NJ, Tzouvelekis LS. (2010) Detecting VIM- 1 production in Proteus mirabilis by a imipenem-dipicolin acid double disk synergy test. J. Clin. Microbiol. 48, 667-668. (IF: 5.897)
75. Giakkoupi P, Pappa O, Polemis M, Vatopoulos AC, Miriagou V, Zioga A, Papagiannitsis CC, Tzouvelekis LS. (2009) Emerging Klebsiella pneumoniae isolates producing KPC-2 and VIM-1
carbapenemases. Antimicrob. Agents Chemoth. 53, 4048-4050. (IF: 4.715)
76. Kotsakis SD, Papagiannitsis CC, Tzelepi E, Tsouvelekis LS, Miriagou V. (2009) Extended-spectrum properties of CMY-30, a Val211Gly mutant of CMY-2 cephalosporinase. Antimicrob. Agents
Chemother. 53, 3520-3523. (IF: 4.715)
77. Papagiannitsis CC, Tzouvelekis LS, Miriagou V. (2008) Relative strength of the uncommon class 1 integron promoters ‘Hybrid 2’ and the ‘Strong’ and the ‘Hybrid 1’ in tandem with the active P2.
Antimicrob. Agents Chemother. 53, 277-280. (IF: 4.715)
78. Miriagou V, Douzinas EE, Papagiannitsis CC, Piperaki C, Legakis NJ, Tzouvelekis LS. (2008) Emergence of Serratia liquefaciens and Klebsiella oxytoca with metallo-beta-lactamase-encoding
IncW plasmids: further spread of the blaVIM-1-carrying integron In-e541. Int. J. Antimicrob. Agents. 32, 540-541. (IF: 4.621)
79. Papagiannitsis CC, Tzouvelekis LS, Tzelepi E, Miriagou V. (2007) Plasmid-encoded ACC-4, an extended-spectrum cephalosporinase variant from Escherichia coli. Antimicrob. Agents Chemother. 51, 3763-3767. (IF: 4.715)
80. Papagiannitsis CC, Loli A, Tzouvelekis LS, Tzelepi E, Arlet G, Miriagou V. (2007) SCO-1, a novel plasmid-mediated class A beta-lactamase with carbenicillinase characteristics from Escherichia coli.
Antimicrob. Agents Chemother. 51, 2185-2188. (IF: 4.715)

Γ. ΒΙΒΛΙΟΜΕΤΡΙΚΑ ΣΤΟΙΧΕΙΑ ΞΕΝΟΓΛΩΣΣΩΝ ΔΗΜΟΣΙΕΥΣΕΩΝ
(01/03/2021)

Δ. ΑΝΑΚΟΙΝΩΣΕΙΣ

i. Διεθνείς Επιστημονικές Συναντήσεις (Προφορικές ανακοινώσεις)
1. Papagiannitsis CC, Studentova V, Dobiasova H, Dolejska M, Hrabak J. Complete Nucleotide Sequence of Two NDM-1-encoding Plasmids from a Sequence Type 11 Klebsiella pneumoniae. 54th Interscience Conference on Antimicrobial Agents and Chemotherapy, Washington 2014.
2. Papagiannitsis CC, Studentova V, Izdebski R, Oikonomou O, Pfeifer Y, Petinaki E, Hrabak J. MALDI-TOF MS, a reliable toll for the direct detection of carbapenemase activity. 25th European
congress of Clinical Microbiology and Infectious Diseases, Copenhagen 2015.
3. Malli E, Voulgaridi I, Tsilipounidaki K, Stefos A, Xitsas S, Piridou P, Papagiannitsis C, Petinaki E. Evaluation of Rapid Polymyxin NP test to detect colistin-resistant Klebsiella pneumoniae in a
tertiary hospital in Thessaly, Greece. 28th European congress of Clinical Microbiology and Infectious Diseases, Madrid 2018.
ii. Διεθνείς Επιστημονικές Συναντήσεις (Γραπτές ανακοινώσεις)
1. Spanelova P, Malisova L, Jakubu V, Del Grosso M, Ramirez MN, Hrabak J, Papagiannitsis C, Zemlickova H. Whole-genome sequencing of 74 Streptococcus pneumoniae isolates of serotype
19A reviewed strong coincidence between sequence types and sequence identities of cps loci and high variability of the genes associated with antibiotic resistance carried by integrative and
conjugative elements. 29th European congress of Clinical Microbiology and Infectious Diseases, Amsterdam 2019.
2. Amlerova J, Bitar I, Medvecky M, Papagiannitsis C, Hrabak J. Genomic characterization of Mycobacterium tuberculosis isolates from Czechia. 29th European congress of Clinical
Microbiology and Infectious Diseases, Amsterdam 2019.
3. Tsilipounidaki K, Papagiannitsis C, Malli E, Petinaki E. Characterization of linezolid-resistant Staphylococcus epidermidis isolates from a Greek hospital. 29th European congress of Clinical
Microbiology and Infectious Diseases, Amsterdam 2019.
4. Tsilipounidaki K, Malli E, Sarrou S, Florou Z, Papagiannitsis C, Petinaki E. Characterization of an lnu(B)-positive ST100 Staphylococcus epidermidis isolated in Greece from samples of animal origin. 28th European congress of Clinical Microbiology and Infectious Diseases, Madrid 2018.
5. Malli E, Tsilipounidaki K, Sarrou S, Florou Z, Voulgaridi I, Papagiannitsis C, Petinaki E. Characterization of ermB-positive staphylococci isolated in Greece from samples of animal
origin. 28th European congress of Clinical Microbiology and Infectious Diseases, Madrid 2018.
6. Dolejska M, Papagiannitsis C, M. Medvecky, L. Davidova Gerzova, A. Valček A. Complete nucleotide sequences of IMP-4-encoding plasmids, belonging to diverse Inc families, recovered
from Enterobacteriaceae of wildlife origin. 28th European congress of Clinical Microbiology and Infectious Diseases, Madrid 2018.
7. Rotova V, Bitar I, Medvecky M, Skalova A, Chudejova K, Jakubu V, Bergerova T, Zemlickova H, Papagiannitsis CC, Hrabak J. Characterization of NDM-like-producing Enterobacteriaceae
isolated in Czech hospitals. 28th European congress of Clinical Microbiology and Infectious Diseases, Madrid 2018.
8. Chudejova K, Kukla R, Papagiannitsis CC, Medvecky M, Habalova K, Hobzova L, Bolehovska R, Pliskova L, Hrabak J, Zemlickova H. Characterization of KPC-encoding plasmids from Enterobacteriaceae isolated in a Czech hospital. 28th European congress of Clinical Microbiology and Infectious Diseases, Madrid 2018.
9. Papagiannitsis C, Papousek I, Hrabak J, Dolejska M. Complete nucleotide sequences of two VIM- 1-encoding plasmids from Klebsiella pneumoniae and Leclercia adecarboxylata isolates of Czech origin. 27th European congress of Clinical Microbiology and Infectious Diseases, Vienna 2017.
10. Papagiannitsis C, Chudejova K, Medvecky M, Skalova A, Rotova V, Jakubu V, Zemlickova H, Hrabak J. Molecular characterization of MBL-producing Pseudomonas aeruginosa isolates in Czech hospitals. 27th European congress of Clinical Microbiology and Infectious Diseases, Vienna 2017.
11. Rotova V, Papagiannitsis C, Skalova A, Chudejova K, Hrabak J. Evaluation and validation of newly developed spectrophotometric HRC assay for detection of carbapenemases in
Enterobacteriaceae. 27th European congress of Clinical Microbiology and Infectious Diseases, Vienna 2017.
12. Chudejova K, Bohac M, Skalova A, Rotova V, Papagiannitsis C, Bergerova T, Hrabak J. Automatic deposition of bacteria and yeast on MALDI target using the MALDI Colonyst robot. 27th
European congress of Clinical Microbiology and Infectious Diseases, Vienna 2017.
13. Papagiannitsis CC, Dolejska M, Izdebski R, Giakkoupi P, Skálová A, Chudějová K, Dobiasova H, Vatopoulos AC, Derde LPG, Bonten MJM, Gniadkowski M, Hrabák J. Complete nucleotide
sequences of three IncA/C2 plasmids carrying In416-like integrons with blaVIM-type genes from Enterobacteriaceae isolates of Greek origin. 26th European congress of Clinical Microbiology and Infectious Diseases, Amsterdam 2016.
14. Skalova A, Chudejova K, Rotova V, Bergerova T, Jakubu V, Zemlickova H, Papagiannitsis CC, Hrabak J. Molecular epidemiological analysis of the first outbreaks of OXA-48-producing
Enterobacteriaceae in the Czech Republic with an evidence of horizontal gene transfer. 26th European congress of Clinical Microbiology and Infectious Diseases, Amsterdam 2016.
15. Hrabak J, Studentova V, Chudackova E, Zemlickova H, Papagiannitsis CC. Ammonium bicarbonate enhances sensitivity of MALDI-TOF MS carbapenem hydrolysis assay for detection
of OXA-48-type producing bacteria. 54th Interscience Conference on Antimicrobial Agents and Chemotherapy, Washington 2014.
16. Studentova V, Papagiannitsis CC, Chudackova E, Bergerova T, Hrabak J. Influence of bicarbonates on sensitivity of diagnostic tests for OXA-48-producing Enterobacteriaceae. 24th European congress of Clinical Microbiology and Infectious Diseases, Barcelona 2014.
17. Hrabak J, Papagiannitsis CC. Detection of beta-lactamases by matrix assisted laser desorption ionization – time of flight (MALDI-TOF) mass spectrometry. 53rd Interscience Conference on Antimicrobial Agents and Chemotherapy, Denver 2013.
18. Hrabak J, Papagiannitsis CC, Heringova V, Jakubu V, Spanelova P, Zemlickova H, Czech participants of European Antimicrobial Resistance Surveillance Network. Occurrence of
Carbapenem-Resistant Enterobacteriaceae (CPE) in the Czech Republic in 2011-2012. 53rd Interscience Conference on Antimicrobial Agents and Chemotherapy, Denver 2013.
19. Giakkoupi P, Tryfinopouloy K, Papagiannitsis CC, Tzelepi E, Pappa O, Voulgaraki M, Tzouvelekis LS, Bou Casals J, Miriagou V, Vatopoulos AC. Evaluation of the modified KPC+MβL confirm ID kit for the phenotypic detection of class A and B carbapenemases in Klebsiella pneumoniae isolates. 22th European congress of Clinical Microbiology and Infectious Diseases, London 2012.
20. Papagiannitsis CC, Tryfinopoulou K, Giakkoupi P, Pappa O, Polemis M, Malamou-Lada E, Orfanidou M, Tsiplakou S, Papaioannou V, Fakiri H, Stamoulos K, Kairis D, Papoutsidou H, Katsifa
H, KasidouF, Tsafaraki E, Tsouri A, Platsouka E, Roussou Z, Kaitsa-Tsiopoulou H, KazilaP, Tzelepi E, Vatopoulos AC. Surveillance of b-lactamase production in a recent sample of Klebsiella
pneumoniae isolated in Greek Hospitals. 21th European congress of Clinical Microbiology and Infectious Diseases, Milan 2011.
21. Gacía-Fernández A, Giordano A, Venditti C, Miriagou V, Papagiannitsis CC, Venditti M, Mancini C, Carattoli A. Emergence in Rome of an ertapenem-resistant Klebsiella pneumoniae clone ST37,
carrying a novel OmpK36 porin variant. 20th European congress of Clinical Microbiology and Infectious Diseases, Vienna, 2010.
22. Miriagou V, Papagiannitsis CC, Kotsakis SD, Zioga A, Siatravani E, Loli A, Tzelepi E, Tzouvelekis LS, Donzelli M, Spickermann J, Page MGP. Efficacy of BAL30072, alone and combined with
meropenem, against VIM-producing enterobacteria in a murine thigh infection model. 20th European congress of Clinical Microbiology and Infectious Diseases, Vienna, 2010.
23. Orfanidoy M, Miriagou V, Papagiannitsis CC, Zioga A, Karabinis A, Malamou-Lada E. Persistence of pan-resistance Acinetobacter baumanii strains recovered from blood cultures in an intensive
care unit. 18th European congress of Clinical Microbiology and Infectious Diseases, Barcenola, 2008.
24. Kraniotaki E, Avlami A, Bekris S, Ganteris G, Malamou-Lada E, Orfanidoy M, Paniara O, Papagiannitsis CC, Platsouka E, Stefanou I, Tzelepi E, Vagiakou E, Miriagou V. Evaluation of the Hyplex®MBL ID multiplex PCR-ELISA system for direct detection of blaVIM and blaIMP genes in blood and other clinical material. 18th European congress of Clinical Microbiology and Infectious Diseases, Barcenola, 2008.
25. Papagiannitsis CC, Loli A, Tzouvelekis LS, Tzelepi E, Arlet G, Miriagou V. ECL-1, a novel plasmidmediated class A beta-lactamase with carbenicillinase characteristics from Escherichia coli. 17th European congress of Clinical Microbiology and Infectious Diseases, Munich, 2007.
iii. Ελληνικές Επιστημονικές Συναντήσεις (Προφορικές ανακοινώσεις)
1. Παπαγιαννίτσης ΚΧ, Πετεινάκη Ε. Ο ρόλος των CRISPR/Cas συστημάτων στην επικράτηση Pseudomonas aeruginosa στελεχών που ανήκουν σε «υψηλού κινδύνου» κλώνους. 1ο Πανελλήνιο Διαδικτυακό Συνέδριο Ιατρικής Βιοπαθολογίας. 2020
2. Μάλλη Ε, Τσιλιπουνιδάκη Κ, Σάρρου Σ, Φλώρου Ζ, Παπαγιαννίτσης ΚΧ, Πετεινάκη Ε. Χαρακτηρισμός ermB-θετικών σταφυλοκόκκων που απομονώθηκαν, στην Ελλάδα, από δείγματα ζωικής προέλευσης. 10ο Πανελλήνιο συνέδριο Ιατρικής Βιοπαθολογίας. Αθήνα, 2018.
3. Τσιλιπουνιδάκη Κ, Μάλλη Ε, Σάρρου Σ, Φλώρου Ζ, Παπαγιαννίτσης ΚΧ, Πετεινάκη Ε. Χαρακτηρισμός ενός lnuB-θετικού ST100 Staphylococcus epidermidis που απομονώθηκε στην
Ελλάδα από δείγμα ζωικής προέλευσης. 10ο Πανελλήνιο συνέδριο Ιατρικής Βιοπαθολογίας. Αθήνα, 2018
4. Παπαγιαννίτσης ΚΧ, Τρυφινοπούλου Κ, Γιακκούπη Π, Παππά Ο, Μαλάμου-Λαδά Ε, Ορφανίδου Μ, Τσιπλάκου Σ, Παπαϊωάννου Β, Φακίρη Ε, Σταμούλος Κ, Καΐρης Δ, Παπουτσίδου Ε, Κατσίφα Ε,
Κεσίδου Φ, Τσααφαράκη Α, Τσουρή Α, Πλατσούκα Ε, Ρούσσου Ζ, Καΐτσα-Τσιοπούλου Ε, Καζήλα Π, Τζελέπη Ε, Βατόπουλος ΑΚ. Χαρτογράφηση β-λακταμάσων σε πρόσφατο αντιπροσωπευτικό
δείγμα νοσοκομειακών στελεχών Klebsiella pneumoniae. 5ο Εθνικό Συνέδριο Κλινικής Μικροβιολογίας κ Νοσοκομειακών Λοιμώξεων. Αθήνα, 2011.
5. Γιακκούπη Π, Παπαγιαννίτσης ΚΧ, Παππά Ο, Πολέμης Μ, Τρυφινοπούλου Κ, Βατόπουλος ΑΚ. MLST τυποποίηση των Klebsiella pneumoniae KPC-2(+) που απομονώνονται στην Ελλάδα. 5ο
Εθνικό Συνέδριο Κλινικής Μικροβιολογίας κ Νοσοκομειακών Λοιμώξεων. Αθήνα, 2011.
6. Πούλου Α Σιατραβάνη Ε, Ζιώγα Α, Παπαγιαννίτσης ΚΧ, Μάρκου Φ, Τσακρής Α, Μυριαγκού Β, Τζελέπη Ε. Χαρακτηρισμός β-λακταμάσων εκτεταμένου φάσματος (ΕΦΒΛ) σε κολοβακτηρίδια
της κοινότητας Βορείου Ελλάδος. 36ο Ετήσιο Πανελλήνιο Ιατρικό Συνέδριο. Αθήνα, 2010.
7. Κωτσάκης ΣΔ, Παπαγιαννίτσης ΚΧ, Τζελέπη Ε, Λεγάκης ΝΙ, Μυριαγκού Β, Τζουβελέκης ΛΣ. Χαρακτηρισμός νέας εκτεταμένου φάσματος β-λακταμάσης τύπου GES φερόμενης από
ιντεγκρόνιο σε κλινικό στέλεχος Pseudomonas aeruginosa. 36ο Ετήσιο Πανελλήνιο Ιατρικό Συνέδριο. Αθήνα, 2010.
8. Μυριαγκού Β, Παπαγιαννίτσης ΚΧ, Κωτσάκης ΣΔ, Τζελέπη Ε, Λεγάκης ΝΙ, Τζουβελέκης ΛΣ. Πλήρης χαρτογράφηση του ενδημικού πλασμιδίου ομάδας ασυμβατότητας IncN που φέρει την VIM-1 β-λακταμάση. 36ο Ετήσιο Πανελλήνιο Ιατρικό Συνέδριο. Αθήνα, 2010.
9. Παπαγιαννίτσης ΚΧ, Ζιώγα Α, Κωτσάκης ΣΔ, Τζελέπη Ε, Τζουβελέκης ΛΣ, Μυριαγκού Β. Συσσώρευση bla γονιδίων διαφορετικής προέλευσης σε ένα IncB/O πλασμίδιο από κλινικό στέλεχος Escherichia coli. 36ο Ετήσιο Πανελλήνιο Ιατρικό Συνέδριο. Αθήνα, 2010.
10. Ορφανιδού Μ, Μυριαγκού Β, Ζούρλα Κ, Παπαγιαννίτσης ΚΧ, Καραμπίνης Α, Μαλαμού-Λαδά Ε. Πανανθεκτικά στελέχη Acinetobacter baumanii απομονωθέντα από καλλιέργειες αίματος ασθενών της μονάδας εντατικής θεραπείας (ΜΕΘ). 4ο Εθνικό Συνέδριο Κλινικής Μικροβιολογίας κ Νοσοκομειακών Λοιμώξεων. Αθήνα, 2009.
11. Ορφανίδου Μ, Αυλάμη Α, Βαγιάκου Ε, Γκαντέρης Γ, Κρανιωτάκη Ε, Μαλάμου-Λαδά Ε, Μπεκρής Σ, Πανιάρα Ο, Πανταζάτου Α, Παπαγιαννίτσης ΚΧ, Πλατσούκα Ε, Στεφάνου Ι, Τζελέπη Ε,
Μυριαγκού Β. Πολυκεντρική μελέτη για την αξιολόγηση μεθόδου Hyplex®MBL ID για την ανίχνευση των blaVIM και blaIMP γονιδίων σε κλινικά δείγματα. 34ο Ετήσιο Πανελλήνιο Ιατρικό Συνέδριο. Αθήνα, 2008.
12. Παπαγιαννίτσης ΚΧ, Τζουβελέκης ΛΣ, Τζελέπη Ε, Μυριαγκού Β. Αξιολόγηση της ισχύος νέου τύπου υποκινητή στα ιντεγκρόνια τάξης 1. 34ο Ετήσιο Πανελλήνιο Ιατρικό Συνέδριο. Αθήνα, 2008.
13. Ζιώγα Α, Τζελέπη Ε, Τζουβελέκης ΛΣ, Τάσιος ΠΘ, Λώλη Α, Παπαγιαννίτσης ΚΧ, Μυριαγκού Β. Οι CMY κεφαλοσπορινάσες στη χλωρίδα των ελληνικών νοσοκομείων την περίοδο 1991-2005. 33ο Ετήσιο Πανελλήνιο Ιατρικό Συνέδριο. Αθήνα, 2007. 14. Λώλη Α, Τζουβελέκης ΛΣ, Τάσιος ΠΘ, Γιαννέλη Δ, Παπαγιαννίτσης ΚΧ, Ζιώγα Α, Τζελέπη Ε,
Μυριαγκού Β. Επιδημική διασπόρά πανανθεκτικών στελεχών Acinetobacter που παράγουν καρβαπενεμάσες τάξης B και D. 33ο Ετήσιο Πανελλήνιο Ιατρικό Συνέδριο. Αθήνα, 2007.
15. Παπαγιαννίτσης ΚΧ, Λώλη Α, Τζελέπη Ε, Ζιώγα Α, Τζουβελέκης ΛΣ, Μυριαγκού Β. Χαρακτηρισμός δύο νέων πλασμιδιακών β-λακταμασών, ECL-1 και ACC-4, από κλινικό στέλεχος Escherichia coli. 33ο Ετήσιο Πανελλήνιο Ιατρικό Συνέδριο. Αθήνα, 2007.
16. Στάθη Μ, Αυγερινού Ε, Μυριαγκού Β, Φλεμετάκης Α, Δανιηλίδου Μ, Παπαγιαννίτσης ΚΧ, Ζίωγα Α, Κυριακής ΚΠ, Τζελέπη Ε. Επιτήρηση της ευαισθησίας του γονοκόκκου στα αντιβιοτικά στην Ελλάδα κατά τα έτη 1994-2005. Δραματική αυξηση αντοχής στις νεότερες κινολόνες. 32ο Ετήσιο Πανελλήνιο Ιατρικό Συνέδριο. Αθήνα, 2006.
17. Παναγιωτακοπούλου Α, Δαϊκος ΓΛ, Λώλη Α, Παπαγιαννίτσης ΚΧ, Ζίωγα Α, Τζουβελέκης ΛΣ, Τζελέπη Ε, Μυριαγκού Β. Αξιολόγηση ιμιπενέμης έναντι στελεχών Klebsiella pneumoniae που
παράγουν μέταλλο-β-λακταμάσες σε πειραματική λοίμωξη σεεΕπίμυες. 32ο Ετήσιο Πανελλήνιο Ιατρικό Συνέδριο. Αθήνα, 2006.
18. Ζίωγα Α, Παπαγιαννίτσης ΚΧ, Λώλη Α, Στάθη Μ, Τζελέπη Ε, Τάσιος ΠΘ, Τζουβελέκης ΛΣ, Μυριαγκού Β. Χαρακτηρισμός Πλασμιδίων Αντοχής στις Κεφαλοσπορίνες. Συμβολή στη Φυλογένεση των β-Λακταμασών τύπου CMY. 32ο Ετήσιο Πανελλήνιο Ιατρικό Συνέδριο. Αθήνα, 2006